赤外顕微鏡とFT-IRを組み合わせた機器の総称です。FT-IRの赤外光を顕微鏡部に取り入れ、カセグレンと呼ばれるミラーで反射させながら集光することで、数µm程度の小さな微小サンプルまで測定出来ます。微小サンプルの場合、高感度なMCT検出器を使用するのが一般的ですが、液体窒素や冷却機構を利用しない室温型検出器を搭載した赤外顕微鏡も利用されます。