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製品詳細

3D/4D 可視化・解析ソフトウェア

IMARIS

型式：IMARIS

3D/4D 可視化・解析ソフトウェア（IMARIS）

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  • 3D/4D 可視化・解析ソフトウェア（IMARIS）

製品概要

高精細な3D/4D 画像解析可能な革新的ツール

3D/4D 可視化・解析ソフトウェア（IMARIS）の特徴

製品概要

Imarisは30年以上にわたり、3D/4D蛍光画像の可視化と解析に特化した技術革新をしてきました。GB/TBサイズの画像データを処理します。複雑な形状のSurfaceや大量のSpotも自在に作成・表示可能で、神経科学、細胞生物学のツールなど、各種解析ツールもご用意しています。画像解析を必要とする方々に向けて、処理が困難である画像用に、トレーニング可能なAIセグメンテーションツールを統合しました。このツールは、すべての Imarisユーザーが利用できます。とても簡単でスムーズな画像をベースとしたトレーニングと、そのリアルタイムの予測プレビューは新しい環境を提供します。自動分析のワークフロー、バッチモードでも利用できます。

Imaris Measurement Pro

輝度や幾何学的数値など計測機能を付加するモジュールです。

  • 機械学習や任意のフィルタによってSpotやSurfaceを分類しラベル付け
  • 検出されたクラスに基づいた計測データのレポートと数値比較
  • 蛍光チャンネル単位で輝度を測定
  • 計測結果に基づいてObjectを色分けすることで、どういった情報を持つかを直感的に認識することが可能
  • 2D上の輪郭線を確認し、3DのObjectを構築
  • Object同士の最短距離や重なりを計算
  • Objectの配置をランダム分布と比較することにより相互作用を測定

Imaris TrackLineage

3D/4D Object Trackingのためのモジュールです。

  • 2D/3D+時間軸のObjectを自動的に追跡
  • 様々なトラッキングアルゴリズムから選択可能
  • 各タイムポイントで数千のObjectを処理
  • 数千のタイムポイントを処理
  • TrackとTracking Objectを自在に編集、作成、修正
  • 速度、変位、輝度、サイズ等の変化の測定
  • 系統樹を細胞周期と世代から表示
  • 並進・回転ドリフトの補正を行うReference Frame
  • タイムラプス中に起こるイベントに同期した測定値の表示


Imaris Coloc

共局在を解析するモジュールです。

  • アルゴリズムに基づいた自動設定を含む、複数の共局在条件設定
  • リアルタイムで統計情報を表示
  • 共局在情報に基づいた新しい3D/4Dチャンネルの作成
  • 特定のROIのみで共局在解析
  • 少ないステップでタイムラプスデータ全体を解析

Imaris ClearView

高速デコンボリューションアルゴリズムを持つモジュールです。

  • NVIDIA/AMDに最適化されたGPU処理
  • Spinning disk confocal、 WF 、 BF、 Confocal、 TIRFの5種類のアルゴリズムから選択可能

Imaris XT

プログラマーがImarisとの間で機能追加やデータ転送を可能にするAPIです。

  • 作成したプラグイン（XTension）でImarisの機能を拡張
  • ImarisとMatlab、Java、Python間で双方向のデータ交換が可能
  • Imaris Openウェブサイトで情報交換(https://imaris.oxinst.com/open/)
  • Labkitを含むFijiへのダイレクトアクセス
  • 70を超えるXTensionsを無料でダウンロード

Filament Tracer

神経細胞、血管、線維状の細胞内コンポーネント等を検出するモジュールです。

  • 大容量の画像でも高速で計算できる3D自動トレース機能
  • Filament TracingのためのAIによるSeed Pointの検出
  • 樹状突起スパインと細胞体の形態学的特徴を検出
  • 血管や細胞内コンポーネントのネットワークをトレース
  • 直径が大きく異なるSegmentや血管を扱うためのMulti scale filament検出
  • 視点を変えるImaris Torchや断面表示を用い、高密度ネットワークのトレーシングも編集可能
  • 細胞体の体積、Dendriteの長さ、直径、表面積、体積、Spine密度、フィラメント形態などの統計情報
  • 形状や位置の経時的な追跡と検出（TrackLineageが必要）


Imaris Cell

細胞群や個々の細胞、そのコンポーネントを細胞単位で解析するモジュールです。

  • 細胞間および細胞内コンポーネント間の関係
  • 生物学的なCell/Nucleus/Vesicleの名称を解析に使用
  • 細胞膜標識のみや、細胞質標識に基づいて細胞検出
  • 複数の小胞グループを検出し分類
  • 2D/3D/4Dのデータで細胞解析
  • 細胞内や細胞間のコミュニケーションなど力学的・構造的な細胞機能の測定
  • 直感的な作成ウィザードにより短時間で解析


Imaris Batch

複数の2D/3D/4D画像をBatchモードで処理・解析することができるモジュールです。

  • Batch処理/解析による時間の節約
  • AIセグメンテーションプロトコルを使用
  • 画像解析プロトコルをインタラクティブに定義
  • 機械学習を含むワークフローをシームレスに統合
  • 画像処理からObject検出まで一連のパイプラインを記録
  • Spot、 Surface、 Cell、 Filamentが使用可能
  • オペレーター不在でも、Imarisライセンスを有効利用

Imaris Vantage

インタラクティブな多次元プロットを使ってデータを表現するモジュールです。

  • 箱ひげ図や5要素までのプロットの作成
  • 2つ以上の画像群や、ラベル付けされたクラス同士を比較
  • 解析結果をプロットのXYZ軸、色分け、表示サイズに使用
  • 傾向や異常値の把握
  • Wilcoxon、 T-test、 F-test、 Kolmogorov-Smirnovの結果を取得し、データをエクスポート
  • 複雑なデータも視覚的にわかりやすく表現
  • 空間的な相互作用プロット
  • イベントで同期させたTimeプロット


Imaris Stitcher

タイリングした顕微鏡画像から1つの2D/3D/4Dデータを作成するためのソフトウェアです。XYZの正確な位置補正、ステージに対するカメラの回転等を補正し、つなぎ合わせます。またImaris Stitcherはシンプルな操作で位置合わせと繋ぎ合わせを行えます。（GB/TBデータに対応）


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主な仕様

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