各種遺伝子クローン20,000,000種類、抗体7,000種類

各種クローンの特徴

• ≫ ORFクローン
• ≫ Source BioScience製品 (IMAGE/MGCクローンなど)
• ≫ Gene Family/Pathwayクローンセット
• ≫ FANTOM^™ クローン
• ≫ 理研Human cDNAクローン
• ≫ 理研Honeybee cDNAクローン
• ≫ CAGEプロモータークローン
• ≫ ラット完全長cDNAライブラリー
• ≫ DNAブック^®

ORFクローン

ORFeome Collaboration※1 により収集されたヒトゲノムから予測される約18,500の全タンパク質コーディング領域(ORF)のコレクションの中から、12,200のヒトORFクローンと1,700のマウスORFクローン、さらにゲノムネットワークプロジェクトで作製された395個のヒトORF entryクローンを販売しております。全てのORFクローンは下記の検索エンジンから検索できます。
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タンパク質をコードする遺伝子は、そのタンパク質合成に必要な遺伝情報を含むOpen Reading Frame (ORF)を構成するmRNAを発現します。多くのタンパク質発現アプリケーションでは、cDNAから未翻訳領域を除きORF領域のみを適切な発現ベクターにクローニングすることが重要です。完全長cDNAをタンパク質発現クローンに転換することは、膨大なcDNAコレクションの機能解析にとって大きな課題のひとつです。
※1：ORFeome Collaboration (OC)
配列決定されたhuman ORF cDNAコレクションの構築を目的とし、2005年に結成。"ORFeome"と呼ばれるヒトゲノムから予測される約18,500の全タンパク質コーディング領域(ORF)が、このプロジェクトによってクローニングされています。ORFeome Collaboration の詳細については、下記サイトをご参照ください。
　≫ ORFeome Collaboration
すべてのORFクローンは、Thermo Fisher Scientific社のGateway^®システムに対応するエントリーベクターにクローニングされています。 Gateway^®システムは、 エントリーベクターのORF配列を効率的に目的ベクターへ転換するための、部位特異的組換えを使用しております。 Gateway^®システムについては下記サイトをご参照ください。
　≫ Life Technologies>Gateway^®テクノロジー(PDF)

Source BioScience製品 (IMAGE/MGCクローンなど)

Source BioScience社(英国ケンブリッジ)が保有するヒト・マウス・ラット・霊長類・線虫・ショウジョウバエ・アフリカツメガエル等の主要なモデル動物のcDNA及びゲノムクローンリソースコレクションです。2千万種類以上のクローンおよび7千種類以上の抗体を収録しています。下記の検索エンジンから検索できます。

1. cDNA Resouces
2. ORF Clones
3. I.M.A.G.E.
4. Genomic Resources
5. miRNA/shRNA/RNAi
6. Sanger Resources
7. Proteomic Resources
8. DNA Aliquots
9. StarGate
10. aCGH Resources

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Gene Family/Pathwayクローンセット

ヒト由来cDNAの各種 Gene Family / Pathway 発現型クローンセットです。
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FANTOM^™ クローン

FANTOM^™ クローンセット
理化学研究所(理研)のマウスゲノムエンサイクロペディアプロジェクトの成果として公開されたFANTOM^™ (Functional Annotation of Mouse) FLS (full-length sequenced) クローンを、セットもしくは個別クローンとして販売しています。FANTOM^™ クローンセットは、3種類が公開されておりクローンのグリセロールストックを384穴プレートに収めた状態で販売しています。
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FANTOM^™ 個別FLSクローン
全長配列の決定されたFANTOM^™ FLS(full-length sequenced)クローン全てについて、個別クローンもしくはリアレイされたクローンセットとしてご注文を承っています。 FANTOM^™ 個別FLSクローンは、組換え大腸菌のスラント培養物としてご提供します。お客様のご希望により、FANTOM^™ 個別FLSクローンから精製したプラスミドDNA(凍結乾燥品10 ug)でのご提供、またはcDNA末端のone-passシーケンスによるID確認サービスも承っております。ただし、発送はご注文いただいた2~3週間後(最短7営業日)になります。
FANTOM^™ 　≫ FANTOM3: FUNCTIONAL ANNOTATION OF MOUSE-3
FANTOM^™ 　≫ FANTOM3 clone set information

FANTOM^™ 個別PSクローン
マウスゲノムエンサイクロペディアプロジェクトで得られた部分配列決定済み（partially sequenced）のFANTOM^™ PSクローンをご提供しています。FANTOM^™ PSクローンの多くは、cDNAの3’末端配列が決定されていますが、幾つかのクローンについては、cDNAの両端配列が決定されています。これらのクローンにおいて、端読みシーケンス以上のアノテーションや配列決定は行われていません。FANTOM^™ 個別PSクローンを個別単位のクローン、もしくはリアレイしたクローンセットとして提供しています。 FANTOM^™ 個別PSクローンは、組換え大腸菌のスラント培養物として提供します。 お客様のご希望があれば、FANTOM^™ 個別PSクローンから精製したプラスミドDNA(凍結乾燥品10ug)でのご提供、または、cDNA末端のone-passシーケンスによるID確認サービスも承っております。ただし、発送はご注文いただいた3~4週間後(最短10営業日)になります。
FANTOM^™ PSクローンの情報は理研の下記サイトよりご確認ください。
　≫ Riken Mouse Encyclopedia Archive

個々のcDNAライブラリー由来のFANTOM^™ PSクローン
マウスゲノムエンサイクロペディアプロジェクトの中で、理研はマウスの様々な組織、発生過程に由来する237個以上の完全長cDNAライブラリーを作製しました。 FANTOM^™ PSクローンは、完全長を多く含む個々のcDNAライブラリーに由来しています。これらのクローンを理研のマスタープレートからグリセロールストックの状態で384穴プレートに収めて提供しています。

免責事項
FANTOM^™ クローンおよびFANTOM^™ クローンセットは実験的な特性を有する製品であり、クローンとクローン関連情報の適合性については、明示する・しないに拘わらず一切保証致しません。また、理研マウスゲノムエンサイクロペディアプロジェクトで作製されたオリジナルプレートには、配列未決定のcDNAクローンが多数含まれています。なお、販売できないcDNAクローンが存在することもあらかじめご了承くださいますようお願いいたします。

理研Human cDNAクローン

ヒトゲノムの研究推進の為、文部科学省の主導でゲノムネットワークプロジェクトが進められました。ゲノムネットワークプロジェクトのキーメンバーである理化学研究所オミックス基盤研究領域ではその成果としてヒトの完全長cDNAライブラリーから膨大な数のcDNAクローンが作製され、このコレクションから311,600個の端読みされた理研Human cDNAクローンを販売しています。さらにゲノムネットワークプロジェクトで作製された395個の理研Human ORFエントリークローンも販売しています。各クローンのアノテーション情報など詳細情報はクローン検索からご確認頂けます。
※ 本シリーズはインサートの末端配列のみが確認されているシリーズとなります。また、クローンは様々な組織・細胞腫から作成されておりますので、SNPやSplicing Variantが混在しています。
そのため、各クローンのSplicingパターンは、末端配列から「推察」して頂くしかなく、保証の対象外となりますのでご注意ください。
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理研クローンは全て、理化学研究所のsub-license agreementに同意を頂いた上で販売しております。 理化学研究所のsub-license agreementのPDF版は下記リンクよりダウンロードできます。
　≫ Sub-Licensing Agreement for the Use of RIKEN cDNA Clones (PDF)

理研Honeybee cDNAクローン

理化学研究所作製のミツバチ完全長cDNAライブラリーから作製されたcDNAクローンコレクションです。全てのクローンは完全長cDNAライブラリーから作製され、3’と5’末端の配列が決定されています。さらに配列が決定されていないcDNAクローンの販売も可能です。各クローンの詳細情報はクローン検索からご確認頂けます。
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理研クローンは全て、理化学研究所のsub-license agreementに同意を頂いた上で頒布しております。 理化学研究所のsub-license agreementのPDF版は下記リンクよりダウンロードできます。
　≫ Sub-Licensing Agreement for the Use of RIKEN cDNA Clones (PDF)

CAGEプロモータークローン

TSS(転写開始点)は本来細胞種、組織種に特異的であることから、それぞれ異なるプロモーターにより制御されています。そのため、従来のコンピューター予測による単一的なプロモータークローンは、細胞種により活性が見られないなどの問題がありました。CAGEプロモータークローンはCAGE法で同定したヒトのTSS情報を網羅することにより、あらゆる細胞種でのプロモーター活性を再現することが可能です。CAGEプロモータークローンは、ヒト細胞からCAGE法により特定した 転写開始点(TSS)周辺領域をクローニングしたもので、主要11パスウェイ下流遺伝子プロモーターを導入したルシフェラーゼレポータークローンとして販売しております。
※ CAGE (Cap Analysis of Gene Expression) 法は、理化学研究所(理研)とダナフォームの技術を基盤とするプロモーター解析手法です。　≫ 製品紹介
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CAGEプロモータークローンのアプリケーション
CAGEプロモータークローンを用いたレポーターアッセイにより、ゲノムワイドな遺伝子発現プロファイル(いつどこでそれぞれの遺伝子がどれくらい発現しているか)を得ることができます。疾患モデルの特徴解明や新しいバイオマーカーおよび腫瘍マーカーの同定などに応用可能です。

関連商品
　≫ CAGEライブラリー：製品概要
　≫ CAGEライブラリー：技術概要

ラット完全長cDNAライブラリー

完全長cDNAライブラリー技術を用いて作成したRat F344由来の完全長率の高いcDNAライブラリーです。ラット由来完全長cDNAライブラリーの完全長率は、最高95%に達します。ラット由来完全長cDNAライブラリーは、クローニングサイズの広いλ-FLC-IIIベクター(500bpから15kbp)を用いて、 ファージライブラリーとして作製したものです。ファージライブラリーから、Cre-loxPシステムを用いてin vitro Excisionを行い、プラスミドライブラリーに変換します。 また、cDNA両端に認識配列の非常に長いホーミング制限酵素配列を挿入している為、プラスミドからのcDNAの切り出しが容易に行えます。

形状
1回増幅ファージDMSOストック (1×10⁶pfu/μl以上を保証)
組換え大腸菌のグリセロールストック (1×10⁵cfu以上を保証)

保存
ファージDMSOストック及び大腸菌グリセロールストックは-80°Cにて保管してください。

品質確認(大腸菌グリセロールストック)
cDNAの平均鎖長解析 (最大24クローン)
cDNA5’側のシーケンス解析 (最大24クローン)

ラット完全長cDNAライブラリーリスト
※ 本ライブラリーは研究用として販売しています。ヒトや動物へは使用しないでください。 医療・臨床診断には使用しないで下さい。

DNAブック^®

DNAブック^® は、理化学研究所で開発された技術で、紙に固定したDNAを書籍の形で販売、常温保存するものです。1冊の本に遺伝子やcDNAクローンに関する「情報」とクローンという「物質」を載せることができます。
通常の宅配便などで多種類のDNAを、印刷された情報とともに研究者に配布することが可能で、研究者は必要なときに容易に必要なDNAを回収することができます。DNAブック^® では、クローンの配布や保存にドライアイスや冷凍庫を必要としません。このため、数千、数万種類のクローンを「本」というコンパクトな形で常備することができます。
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DNAブック^® の特徴
1. DNAの情報と物質そのものが一緒に印刷（固定化）されています。
2. PCRを使って簡単に回収することができます。
3. 容易に輸送ができます。
4. 研究室の通常環境で保存可能です。

また、特殊なDNAプリンターにより多部数の製作が可能なので、多くの研究者が同一のクローンを用いて研究することができます。 試作的に出版されたものとしては、ヒトメタボローム遺伝子を収集したDNABook^® 、魚類の遺伝解析・疾病診断に関するDNABook^® などがあります。

ジャンル別DNAブック^®
ジャンル別DNAブック^® は、FANTOM^™ およびその他のcDNAクローンを集め、各々がコードするタンパク質の機能（転写因子、キナーゼなど）、局在（膜タンパク質、核内タンパク質など）、又は関連する生命現象（細胞周期、アポトーシスなど）などのカテゴリーごとに分類し、それぞれを1冊のDNAブック^® にまとめたものです。 1冊単位での販売に加え、シート1枚(48クローン)からの販売も承っております。
この本は、プラスミドにクローニングされたcDNAクローンを、1シートあたり約48種類のクローンx4スポットずつ染み込ませています。
DNAブック^® からのDNAの回収は簡単です。切り取ったスポット片に適当なバッファーを加えると、水溶性の紙が溶け、DNAが溶出されます。これをPCRまたは大腸菌の形質転換※1 により増幅します。
現在、ジャンル別に本単位での販売およびシート単位での販売を行っております。
※1 ：大腸菌による形質転換につきましては、cloneにより回収が難しいものもございます。
● FANTOM^™ 3転写因子ブック
理研FANTOM^™ 3クローンの中から論文により選択した1588種類のマウス由来転写因子の完全長cDNAを全34ページに掲載。 1ページあたり48クローンを掲載(1クローンあたり4スポット)しており、1スポットのDNA量は約5 ngとなります。また、一枚からでもご注文いただけます。

● FANTOM^™ 3 転写因子ブック
理研FANTOM^™ 3クローンの中から論文により選択した1588種類のマウス由来転写因子の完全長cDNAを全34ページに掲載。 1ページあたり48クローンを掲載(1クローンあたり4スポット)しており、1スポットのDNA量は約5ngとなります。また、1枚からでもご注文いただけます。
A genome-wide and nonredundant mouse transcription factor database Kanamori et. al, (BBRC 322/3 pp. 787-793).

● FANTOM^™ 3キナーゼブック
理研FANTOM^™ 3クローンの中からGO termsを用いて選択した898種類のマウス由来キナーゼの完全長cDNAを全19ページに掲載。 1ページあたり48クローンを掲載(1クローンあたり4スポット)しており、1スポットのDNA量は約5ngとなります。また、1枚からでもご注文いただけます。

● FANTOM^™ 3フォスファターゼブック
理研FANTOM^™ 3クローンの中からGO termsを用いて選択した180種類のマウス由来キナーゼの完全長cDNAを全4ページに掲載。 1ページあたり48クローンを掲載(1クローンあたり4スポット)しており、1スポットのDNA量は約5ngとなります。また、1枚からでもご注文いただけます。

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